Съгласно Закона за лечебните заведения, Министерският съвет определя по предложение на министъра на здравеопазването лечебните заведения, които придобиват правата на университетски, след одобрението им от министъра на здравеопазването за обучение на студенти и специализанти в системата на здравеопазването, посочват от правителството.
По предложение на министъра на здравеопазването и въз основа на мотивирано искане от ректора на Медицински университет - София, съгласувано с изпълнителния директор на УМБАЛ „Царица Йоанна – ИСУЛ, Министерският съвет определи на лечебното заведение статут на университетска болница. Решението е взето и съгласно критериите, заложени в Наредбата за критериите за определяне на университетски болници.
През 2000 г. лечебното заведение е наречено Многопрофилна болница за активно лечение „Царица Йоанна”. През ноември 2007 г. наименованието се променя на Многопрофилна болница за активно лечение „Царица Йоанна – ИСУЛ”, а през декември 2007 г. – на Университетска многопрофилна болница за активно лечение „Царица Йоанна – ИСУЛ”, се посочва се на интернет страницата на лечебното заведение.
В болницата през 1951 г. за първи път е проведен четиримесечен курс за специализация по клинична лаборатория, извършена е първата бъбречна биопсия през 1969, проведена е и първата перитонеална диализа през 1971 г., пише още в сайта на здравното заведение.