Центърът извършва научна оценка на риска по въпроси, които пряко или косвено засягат здравето на животните и растенията, растителните продукти и растителния репродуктивен материал, както и безопасността на храните и фуражите. Той е компетентен орган и по отношение на оценката на продукти за растителна защита.
Изготвените от ЦОРВХ научни становища се предоставят на компетентните органи и институции и служат като основа за вземане на информирани решения в управлението на рисковете по хранителната верига, припомнят от правителствения пресцентър.