Израелски учени разкриха досега неизвестен пласт от биологията на рака - стотици миниатюрни протеини, произвеждани от генетичен материал, за който дълго време се смяташе, че служи основно за регулиране на гените, предаде израелската новинарска агенция ТПС.
Откритието предоставя на изследователите нова група молекули, които да проучат в опитите си да разберат как ракът възниква и се развива.
Според изследователския екип от Еврейския университет в Йерусалим тези протеини, известни като микропептиди, са свързани с различни стадии на рака при 17 вида тумори. Някои от микропептидите в бъдеще биха могли да помогнат за проследяване на развитието на заболяването, докато други могат да разкрият нови начини, по които туморите взаимодействат с имунната система, или да посочат потенциални мишени за бъдещи терапии.
Учените отдавна знаят, че някои дълги некодиращи РНК, или участъци от генетичен материал, за които обикновено се смята, че регулират гените, вместо да произвеждат протеини, могат да кодират миниатюрни протеини, наречени микропептиди. Досега обаче не беше ясно колко широко разпространени са тези молекули при различните видове рак и дали определени микропептиди са свързани с промени в развитието на заболяването.
За да проучат това, изследователите анализираха данни от близо 10 000 тумора, представляващи 17 вида рак. Те комбинираха геномни данни за раковите заболявания с рибозомно профилиране, което може да помогне за установяване на генетичните последователности, използвани за производство на протеини. След това учените използваха структурно моделиране с изкуствен интелект, за да изследват хиляди потенциални микропептиди.
Анализът установи 1782 микропептида с висока степен на достоверност, кодирани от 478 ИнкРНК гена. От тях 314 са свързани със значителни промени между различните стадии на рака.
„В продължение на години тези РНК до голяма степен бяха пренебрегвани като източник на протеини“, заяви Став Зок, един от авторите на изследването. „Като съчетахме големи масиви от данни за ракови заболявания с изчислителни инструменти и инструменти, базирани на изкуствен интелект, успяхме систематично да открием стотици пренебрегвани досега потенциални микропептиди, които през цялото време са били пред очите ни.“
МИКРОПЕПТИДИ, СВЪРЗАНИ С РАКА
Изследователите установиха също, че много от микропептидите имат отличителни характеристики на последователността и структурата си, което предполага, че някои от тях може да изпълняват биологични функции, които тепърва предстои да бъдат проучени.
„Нашите открития показват, че дългите некодиращи РНК може да допринасят за развитието на рака по повече начини, отколкото се смяташе досега“, заяви проф. Михал Линиал от Катедрата по биохимия на университета. „Тези скрити микропептиди представляват до голяма степен неизследван клас молекули, който може да ни помогне да разберем по-добре развитието на рака.“
Изследователите идентифицираха микропептиди, които потенциално могат да се използват като биомаркери за проследяване на развитието на рака. Те установиха и потенциални микропептиди, които може да участват в представянето на пептиди върху повърхността на туморните клетки, което може да влияе върху взаимодействието между туморните и имунните клетки.
Учените подчертаха, че са необходими допълнителни изследвания, за да се установи кои микропептиди изпълняват биологични функции и дали влияят пряко върху растежа и разпространението на туморите или върху други аспекти на раковите заболявания.
Резултатите от изследването са публикувани в рецензираното научно списание „Бритиш Джърнъл ъв Кенсър" (British Journal of Cancer).
(Тази информация се разпространява по споразумение между БТА и ТПС)