Проблемите на Тимошчук започнаха на 24 февруари 2022 година, когато Русия нахлу в Украйна. Тогава бившият капитан на украинския национал отбор, който е помощник-треньор на руския гранд Зенит Санкт Петербург, отказа да заклейми руската агресия.
Близо две седмици по-късно той пише в профила си в Инстаграм: "Имаме нужда от мир. За доброто на нашите деца и нашите родители, за доброто на живота на земята". Тимошчук не споменава нито дума да агресора, което е прието като предателство в Украйна.
Така през март 2022 година Украинската футболна федерация маха бившата звезда от тима, заличава рекордните му 144 мача за националния отбор, лишава го от всички трофеи на украинска земя и анулира треньорските му дипломи. Анатолий Тимошчук няма право да работи в сферата на футбола в родината си.