"Мюлер принадлежи на Байерн, както (катедралата) Фрауенкирхе принадлежи на Мюнхен. Той е роден край града, израснал е в този клуб и вече се е превърнал в негова легенда, въпреки че все още играе. Много малко футболисти постигат това. Кариерата му е осеяна с исторически постижения. Никога няма да има друг играч като Томас Мюлер", каза Хайнер, цитиран от официалния сайт на Байерн.
Мюлер е продукт на академията на Байерн. С "червените" нападателят спечели Бундеслигата 12 пъти, Купата на Германия 6 пъти и Суперкупата на страната 8 пъти. Той също спечели два пъти трофея Шампионската лига.